大陆方面4日宣布启用穿越台湾海峡的M503北上航线以及从厦门、福州、东山到M503之间的三条连接航线。这本是大陆的正常民航线路安排，却遭到台湾当局的激烈非议。台陆委会、“国防部”等宣称该航线的开通威胁到台湾的空防安全，要求大陆立即停止使用该航线。这种无理要求当然不会被大陆方面接受。

1月5日，上海海上搜救中心11时53分接报，事故现场打捞船“东南起12”轮潜水员在沉船“长平”轮三楼至四楼的过道内发现一具遇难者遗体，具体身份正在核实之中。这是继4日下午之后的第二具遇难者遗体。目前，尚有8人下落不明。

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